Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrit3W8DXL4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms