Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms