Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Knop1Q9Z2Q2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms