Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms