Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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