Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn9Q9Z0S7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn9Q9Z0S7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms