Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx1Q9WV80 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx1Q9WV80 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms