Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArcQ9WV31 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms