Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms