Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry2Q9R194 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms