Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc3Q9R0B6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc3Q9R0B6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms