Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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