Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms