Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Col4a4Q9QZR9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms