Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gpc1Q9QZF2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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