Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms