Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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