Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2e3Q9QXZ7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms