Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms