Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms