Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rabgef1Q9JM13 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rabgef1Q9JM13 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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