Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr5Q9JLF7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr5Q9JLF7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms