Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CubnQ9JLB4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms