Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms