Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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