Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms