Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Pgpep1Q9ESW8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Pgpep1Q9ESW8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Pgpep1Q9ESW8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Pgpep1Q9ESW8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Pgpep1Q9ESW8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Pgpep1Q9ESW8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Pgpep1Q9ESW8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms