Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn10Q9ESK3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms