Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Erg28Q9ERY9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms