Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MesdQ9ERE7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms