Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms