Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms