Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trmt112Q9DCG9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trmt112Q9DCG9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms