Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms