Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms