Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms