Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms