Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sgf29Q9DA08 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgf29Q9DA08 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgf29Q9DA08 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgf29Q9DA08 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgf29Q9DA08 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgf29Q9DA08 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgf29Q9DA08 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sgf29Q9DA08 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgf29Q9DA08 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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