Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp12Q9D9M2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms