Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms