Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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