Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nop56Q9D6Z1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nop56Q9D6Z1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nop56Q9D6Z1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nop56Q9D6Z1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nop56Q9D6Z1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Nop56Q9D6Z1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop56Q9D6Z1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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