Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms