Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PrameQ9D4Z5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms