Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc6Q9D4E6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc6Q9D4E6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms