Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UvssaQ9D479 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms