Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms