Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms