Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Mrpl53Q9D1H8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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