Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms